Microbiota colonului reprezinta totalitatea bacteriilor rezidente in intestin si care au o relatie simbiotica cu organismul nostru. Ea joaca un rol esential in sanatatea organismului prin participarea sa la realizarea unor functii importante, precum prevenirea invaziei microorganismelor patogene, imbunatatirea functiei celulelor intestinale, intarirea sistemului imunitar, sintetizarea unor vitamine, stimularea miscarilor musculaturii intestinale pentru asigurarea tranzitului si reducerea senzatiilor neplacute de disconfort si balonare, evitarea proceselor inflamatorii intestinale.

Modificarile calitative si cantitative ale microbiotei colonului, ale activitatii sale metabolice si ale distributiei acesteia poarta numele de disbioza intestinala. Acest dezechilibru este implicat in aparitia unor tulburari digestive (boli inflamatorii intestinale, patologii biliare, maldigestie, etc.), dar si a unor boli sistemice precum obezitate, sindrom metabolic, boli cardiovasculare si vasculare periferice, astme bronsic si atopii, tulburari neurologice, alterarea capacitatii de metabolizare a unor medicamente.